Một đoạn hội thoại thường gặp giữa người chơi và nhân vật Saionji Sekai trong visual novel School Days. Thể hiện rõ tính năng riêng biệt của trò chơi: hộp thoại đã được ẩn, sử dụng chế độ lồng tiếng và toàn màn hình, y như một anime.

Giống như những visual novel truyền thống, cách chơi của School Days chỉ đòi hỏi người chơi tương tác ở một vài đoạn, phần lớn thời gian còn lại là đọc những dòng chữ xuất hiện trên màn hình, thường mô tả đoạn đối thoại giữa các nhân vật khác nhau xen lẫn suy nghĩ nội tâm của nhân vật chính. Người chơi chỉ có thể tương tác khi những "điểm quyết định" hiện ra và có vài lựa chọn được đưa ra. Các "điểm quyết định" này thường thay đổi và xuất hiện không đều đặn, có thể cách nhau ít phút hoặc lâu hơn. Trong khi người chơi đang phân vân giữa các lựa chọn, visual novel sẽ dừng lại chờ cho đến khi người chơi đưa ra quyết định, sau đó cốt truyện sẽ tiến triển theo một hướng nhất định. Những sự lựa chọn đó được gắn kết với từng mạch truyện chứa nhiều tình huống khác nhau, tất cả đều dẫn đến những cảnh khiêu dâm và một trong số 21 kết thúc có thể đạt được[2]. Như vậy, mỗi kịch bản đòi hỏi người chơi phải chơi lại nhiều lần, mỗi lần lại chọn những hướng khác nhau để đạt được những kết thúc tương ứng, từ đó mới nắm bắt được nội dung của toàn bộ visual novel. Tuy nhiên, School Days cũng mang một số yếu tố khác biệt rõ rệt so với những tựa game cùng loại, đó là mang đến cho người chơi những hình ảnh động, thay vì đồ họa tĩnh như bình thường, và những cảnh đó được chia đều ra như những tập phim hoàn chỉnh với những đoạn video mở đầu và kết thúc rất đặc biệt, điều này khiến visual novel trở nên giống với anime hơn. Trò chơi sử dụng hệ thống âm thanh nổi với một album chứa 31 track nhạc nền, hiệu ứng âm thanh và giọng lồng tiếng. Người chơi có đến 10 ngăn lưu để tạm dừng cuộc chơi trong quá trình thưởng thức nếu muốn[2].

Có một vài tùy chỉnh thêm khác nhằm thay đổi cách chơi, bao gồm: phát lại video theo tốc độ 1×, 1.5×, 2×, 4×, hoặc tạm dừng; tự động chơi cho đến khi đến "điểm quyết định"; tinh chỉnh tăng giảm âm lượng, tắt hay bật giọng lồng tiếng; hiện hay ẩn các hộp thoại như trong bản vá 1.11; và khả năng chơi ở chế độ toàn màn hình hoặc màn hình thu nhỏ trong khung cửa sổ[3].